Según el tipo de reacciones que catalizan:
- Hidrolasas: Reacciones de hidrólisis. Se produce la rotura de enlaces por la incorporación de una molécula de agua.
- Isomerasas: Reacciones de transferencia de grupos para dar lugar a formas isoméricas.
- Liasas: Reacciones en las que se produce una rotura de enlaces sin la incorporación de una molécula de agua.
- Ligasas: Unión de moléculas. Requiere la aportación de energía que proviene, normalmente, de la rotura del enlace fosfato del ATP.
- Oxidorreductasas: Reacciones de oxidación-reducción mediante la transferencia de electrones.
- Transferasas: Reacciones de transferencia de grupos. Pueden ser grupos fosfato, amina, metilo...
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